分生

エピジェネティクス

遺伝子配列だけでは決まらない表現型や、同一の遺伝子から異なる表現型が生じる機構などの解析を対象とする。 エピジェネティックな記憶は、細胞分裂では安定に保たれるが、可逆的に書き換え可能である。哺乳動物のゲノムインプリンティングや生物の個体発生…

核小体オーガナイザー

リボソームRNAをコードする遺伝子をリボソームDNA遺伝子という。 ヒトではゲノム辺り200個のリボソームDNA遺伝子が5つの染色体(13,14,15,21,22)の単腕上に分かれて反復して配列しており、核小体オーガナイザーとよばれる。

RNAの編集

転写産物のコード特性を変化させ、指定するタンパク質のアミノ酸配列に影響を与えるmRNAの塩基を化学修飾のこと。 ヒトアポリポタンパク質B-48はB-100の編集から生ずる。特定のシトシンの脱アミノ化によりウラシルを生じ、停止コドンが導入されることによる。

トランスポザーゼ

transposase トランスポゾンの転移に働く酵素。トランスポゾンにコードされており、両末端の逆方向反復配列に結合し、トランスポゾン末端のDNAに切断を入れ、転移の標的部位とのDNA組換え反応を引き起こす。 逆方向反復配列 同一分子上に存在する逆方向に相…

gag

group specific antigen ウイルスの構造タンパク質をコードする遺伝子。ウイルス由来のプロテアーゼにより6つの断片に切断される。

複製的トランスポゾン

RNA中間体を介する(レトロ転移)。レトロウイルスと類似。 RNAトランスポゾン(レトロポゾン) 真核生物ゲノムの特徴的。LTR長鎖末端反復配列の有無により分類 内在性レトロウイルス LTR, gag, pol, envをもつがいずれかが変異をもち機能を失っている(ERV…

レトロポゾン

DNAから転写されたRNAの遺伝情報が逆転写酵素によりDNAに戻され、ゲノム内に挿入された配列の総称。 逆転写酵素をコードしているもの レトロウイルス(LTRに加えenvをもつ) レトロトランスポゾン LTR型 LINE(非LTR型) 逆転写酵素をコードしていないもの S…

LTR

Long terminal repeatの略。レトロウイルスのプロウイルスの両末端にある300-1300bpの構造。逆転写酵素によりウイルスRNAがDNAに変換される際に形成される。 転写プロモーターとポリA付加シグナルをもつ。新しいウイルスRNAの合成は5'側LTRのプロモーター活…

プライマーゼ

DNA依存オリゴヌクレオチド合成酵素の総称。DNA複製のプライマー合成に関与する。 大腸菌ではDnaGタンパク質と呼ばれる。プライマーゼはDnaBタンパク質とともにプライモゾームの成分として不連続複製の開始に関与している。 真核細胞のプライマーゼはαアマニ…

リンキング数

二本鎖DNAが互いに難解絡まり合っているかを示す数。10.5塩基対が1回転に相当するので、塩基対数を10.5で割った値がリンキング数である。(値は整数値) 閉環状DNAは鎖の切断をしなければリンキング数は変えられないから、リンキング数はDNA分子が持つ固有…

DNAトポイソメラーゼ

二本鎖DNAに一時的に切れ目を入れ、その間を別のDNA鎖に通過させた後に切れ目を閉じて、結果的にDNA のリンキング数を変える反応を触媒する。 二本鎖の一歩に切れ込みを入れるⅠ型(リンキング数1減らす)と、二本鎖両方を切るⅡ型がある。(リンキング数2つ…

DNAヘリカーゼ

DNA巻き戻しタンパク質。 ATP加水分解のエネルギーを用いて二重らせんを不安定化し、二本鎖DNAを巻き戻し(アンワインディング)て一本鎖DNAに変換する活性をもつ酵素。 複製フォークで二本鎖DNAの巻き戻しとプライマーゼ、DNAポリメラーゼの活性促進 組換え…

トポロジー

場所、空間は位置に関する学問または情報をいう。位相幾何学、位相数学。

反復配列

散在性反復配列 LINE レトロポゾンの一種で、長い散在性の反復配列。非LTL型レトロトランスポゾンの別名になっている。ヒトゲノム中のLINEをL1と呼び、ヒトゲノムの14%以上を占める。L1は6.5kbpあり、逆転写酵素やエンドヌクレアーゼをコードする2つのORF…

レトロトランスポゾン

転写された遺伝情報が逆転写酵素により相補的なDNAに合成され、ゲノム中に再挿入された配列をレトロポゾンという。そのうち、逆転写酵素をコードしているレトロウイルス、レトロトランスポゾン、逆転写酵素をコードしていないSINE、偽遺伝子、等に分けられる…

トランスポゾン

転移性遺伝因子のひとつ。 DNA上を他の場所に移動するDNA単位。薬剤耐性因子を含む細菌のTn、ショウジョウバエのP因子、トウモロコシのAcが知られている。 一般にランダムな位置に転移する。 トランスポゾンの両端に逆方向反復配列があり、末端部の組換えが…