かつてミクロボディとよばれていた細胞小器官。
カタラーゼ、および過酸化水素を産生するオキシダーゼを含む。アセチルCoAの代謝系や電子伝達系は存在しない。ほ乳類ではプラズマローゲン（エーテルリン脂質）や胆汁酸生合成なども行っている。
ペルオキシソーム欠損症（ツェルベーガー症候群）は致死。病因となる遺伝子はペルオキシン遺伝子（PEX）として同定されている。
ペルオキシソーム増殖剤（抗高脂血症剤、プラスチック可塑剤）でペルオキシソーム酵素（β酸化系酵素）の誘導とペルオキシソームの増殖が見られる。
核内受容体スーパーファミリーのPPARがリガンド（脂肪酸、プロスタグランジン類）と結合し遺伝子発現を調節する。
